De 34-jarige Limburger werkte eerder in de jeugdopleiding van Ajax, PSV en NAC Breda. Bij laatstgenoemde club was hij ook assistent van het eerste elftal, onder Ruud Brood. Na diens ontslag (op 31 december 2019) nam Weijs het zes weken over. Onder zijn leiding schakelde NAC bijvoorbeeld PSV uit in het toernooi om de KNVB-beker.

Desondanks stelde NAC een nieuwe trainer aan: Peter Hyballa. De Duitser had in zijn staf vervolgens geen plek voor Weijs, die wel aan de slag kon als trainer van Jong NAC. Dat zag Weijs echter niet zitten en er ontstond een arbeidsconflict tussen beide partijen, waarna de talentvolle trainer vertrok en in juli 2020 in Tilburg dus aan de slag ging als trainer van de Onder-21.

De nieuwe beloftencompetitie werd vorig seizoen al in oktober afgebroken vanwege het coronavirus, waardoor Weijs vooral trainingen leidde in plaats van wedstrijden. Wel zat hij enkele keren op de bank bij het eerste elftal, naast interim-trainer Zeljko Petrovic. Afgelopen zomer bleef hij aan als eindverantwoordelijke bij Willem II Onder-21, ook al wilde FC Eindhoven hem als hoofdcoach hebben.

De lokroep van Anderlecht kon Weijs nu niet weerstaan. Bij de Belgische topclub is hij de nieuwe rechterhand van Vincent Kompany, de ex-aanvoerder van onder meer de Rode Duivels en Manchester City. Bovendien treft hij er oude bekende Jelle ten Rouwelaar, die keeperstrainer is in Brussel. Met verdediger Wesley Hoedt en spits Joshua Zirkzee zijn er ook twee Nederlandse spelers bij Anderlecht, dat op een vijfde plaats staat in de Jupiler Pro League met 13 punten na zeven duels. Weijs is de opvolger van oud-prof Craig Bellamy, die onlangs stopte omdat hij met een depressie kampt. 

Het is nog niet bekend hoe Willem II het vertrek van Weijs gaat opvangen. Zijn assistenten bij de Onder-21 zijn oud-spelers Bruno Andrade en Jasper Waalkens.